Vergelijking

Beste boekhoudsoftware voor accountants en boekhouders in 2026

Redactie Beste Boekhoudprogramma ZZP Bijgewerkt 28 oktober 2026 8 min leestijd

Zoek je de beste boekhoudsoftware voor een accountantskantoor, een administratiekantoor of je praktijk als zelfstandig boekhouder, dan kom je steeds dezelfde namen tegen: Exact Online, Twinfield, Cleverboek, Yuki, Minox, AFAS en e-Boekhouden.nl. In de marketing lijken ze op elkaar, maar ze zijn gebouwd voor verschillende soorten kantoren. Hieronder zetten we ze naast elkaar, met per pakket waar het de beste keuze voor is.

Transparantie: deze website heeft een commerciële band met Cleverboek. We noemen daarom ook duidelijk waar andere pakketten beter passen.

Eerst je eigen werk, dan het pakket

Een kantoor is geen standaardklant. Het ene kantoor stelt jaarrekeningen samen voor mkb-bedrijven met personeel en voorraad. Het andere verzorgt vooral de lopende boekhouding en btw-aangifte van zzp'ers en kleine bv's. Die twee hebben andere software nodig, ook als ze zichzelf allebei accountantskantoor noemen.

  • Samenstellen en dossierbeheer. Is dat je hoofdwerk, dan kijk je naar Exact Online, Twinfield, Minox en Yuki.
  • Lopende administratie samen met de klant. Verwerk je vooral facturen, bonnen en bankmutaties en doe je de btw-aangifte, terwijl de klant zelf factureert en aanlevert? Dan draait het om samenwerken en een voorspelbare prijs per klant. Daar is Cleverboek voor gebouwd.

Vergelijking op hoofdlijnen

SoftwareBeste voorPrijsmodel
Exact OnlineAllround voor kantoren met mkb-klantenModulair, per gebruiker en pakket
TwinfieldVeel administraties en maatwerkrapportagesPer gebruiker en per administratie
CleverboekSamenwerken met klanten in de lopende administratie, onbeperkt medewerkers€5 excl. btw per klantadministratie per maand, alle functies
YukiGeautomatiseerde documentverwerkingPer klantdossier, afhankelijk van pakket
MinoxSamenstellen en dossierbeheerPer klantdossier
AFAS Accountancy SuiteGrote kantoren die CRM, financiën en HR willen bundelenMaatwerkofferte
e-Boekhouden.nlLaagdrempelige startStaffelprijzen per module

Prijzen en functies zijn indicatief en kunnen door de leverancier gewijzigd zijn. Vraag altijd de actuele voorwaarden op.

De pakketten op een rij

1. Exact Online

Beste voor: allround gebruik op kantoren met mkb-klanten.

Exact Online is het bekendste platform en wordt breed gebruikt door mkb-bedrijven en de kantoren die hen bedienen. Naast boekhouden zijn er modules voor CRM, project- en voorraadbeheer. Die breedte heeft een prijs: hoe meer modules en gebruikers, hoe hoger de maandelijkse rekening.

Sterk punt: veel functionaliteit en schaalbaarheid voor complexere klanten.

2. Twinfield

Beste voor: kantoren met veel administraties en maatwerkrapportages.

Twinfield is bij veel boekhouders favoriet voor kantoren die dagelijks in de cijfers zitten. Batchverwerking, tot zes rapportagedimensies en een uitgebreide rapportage-editor maken het sterk als je veel maatwerkrapportages voor klanten oplevert.

Sterk punt: een kantoorgerichte werkwijze met uitgebreide rapportage en controle.

3. Cleverboek

Beste voor: samenwerken met je klanten in de lopende administratie, tegen een vaste prijs per klant en zonder kosten per medewerker.

Cleverboek is gebouwd rond de samenwerking tussen kantoor en klant. De klant werkt in zijn eigen administratie: hij maakt facturen, stuurt inkoopfacturen door of fotografeert een bon, en scan en herken zet de gegevens klaar als boeking. De bankkoppeling haalt transacties automatisch op en de boekhoudbot herkent per administratie de posten die vaker voorkomen. Jij of je medewerker beoordeelt, rondt af en doet de btw-aangifte, in dezelfde actuele cijfers als je klant.

Het kantoor betaalt €5 exclusief btw per klantadministratie per maand, met alle functies. Niet per gebruiker: een extra boekhouder, assistent of stagiair kost niets. Geen staffel, geen losse modules, geen opstartkosten en maandelijks opzegbaar per administratie. Voor de klant zelf is Cleverboek onbeperkt gratis, inclusief support via chat.

Sterk punt: samenwerken tussen ondernemer en boekhouder, met een voorspelbare prijs per klant, hoe groot je team ook wordt.

4. Yuki

Beste voor: kantoren die documentverwerking maximaal willen automatiseren.

Yuki zet zwaar in op automatische documentherkenning en AI-controles, en richt zich op de accountantspraktijk met dossierbeheer en samenstelwerk.

Sterk punt: automatisering die handmatig werk beperkt.

5. Minox

Beste voor: kantoren waar samenstellen en dossierbeheer de kern zijn.

Minox is specifiek gebouwd voor de accountantspraktijk, met de nadruk op samenstellen en dossierbeheer. Voor kantoren waar dat het hoofdwerk is, is het vaak een van de eerst overwogen opties.

Sterk punt: focus op de professionele accountancypraktijk.

6. AFAS Accountancy Suite

Beste voor: grotere kantoren die alles in één systeem willen.

AFAS is geen boekhoudpakket met extra's, maar een systeem voor de hele bedrijfsvoering, waarin boekhouden, CRM en personeelszaken samenkomen. Aantrekkelijk voor middelgrote tot grote kantoren; voor een klein kantoor is het vaak meer dan nodig.

Sterk punt: brede integratie van bedrijfsprocessen.

7. e-Boekhouden.nl

Beste voor: een laagdrempelige start met een eerste klantenkring.

e-Boekhouden.nl wordt vaak genoemd als toegankelijke optie voor kantoren die net beginnen. Door de staffelprijzen per module is wel lastiger te voorspellen wat je bij twintig of vijftig klanten betaalt.

Sterk punt: laagdrempelig, met een directe koppeling met de Belastingdienst.

Wat het prijsmodel betekent als je kantoor groeit

Bij veel kantoorpakketten groeit de rekening op twee manieren mee: met het aantal klanten en met het aantal medewerkers. Dat tweede remt juist de groei die je wilt, want elke nieuwe collega maakt je software duurder voordat die collega iets oplevert. Bij Cleverboek telt alleen het aantal klantadministraties (bedragen exclusief btw):

  • Zelfstandig boekhouder met 15 klanten: €75 per maand.
  • Administratiekantoor met 60 klanten en 4 medewerkers: €300 per maand.
  • Hetzelfde kantoor met 7 medewerkers: nog steeds €300 per maand.
  • Een portefeuille van 100 klanten: €500 per maand, ongeacht het aantal collega's.

Combineren is normaal

In de praktijk gebruiken veel kantoren twee pakketten: complexe dossiers in Exact Online, Twinfield, Minox of Yuki, en de zzp- en mkb-administraties in Cleverboek. Voor dat tweede deel betaal je bij de gespecialiseerde suites vaak voor functies die je nooit gebruikt, terwijl je klanten juist baat hebben bij een eenvoudig pakket waarin ze zelf factureren en aanleveren. De uitgebreide versie van deze vergelijking staat in de kennisbank van Cleverboek.

Conclusie

De beste boekhoudsoftware voor accountants en boekhouders is niet één pakket voor je hele kantoor, maar de juiste match per type klant. Exact Online en Twinfield zijn de sterkste allrounders voor complexere mkb-klanten. Cleverboek is de beste keuze voor kantoren die met hun klanten samenwerken in de lopende administratie en een vaste prijs per klant willen, zonder te betalen voor elke nieuwe collega. Voor samenstellen en dossierbeheer blijven Minox en Yuki voor de hand liggende keuzes. Ben je zelf zzp'er? Lees dan de vergelijking van boekhoudprogramma's voor zzp'ers.

Veelgestelde vragen

Wat is de beste boekhoudsoftware voor accountants en boekhouders in 2026?

Er is niet één winnaar voor elk kantoor. Exact Online en Twinfield zijn de sterkste allrounders voor kantoren met complexere mkb-klanten. Cleverboek is de beste keuze voor kantoren die met hun klanten samenwerken in de lopende administratie en een vaste prijs per klant willen, zonder te betalen voor elke nieuwe collega.

Welk boekhoudprogramma is het beste voor samenwerken tussen boekhouder en klant?

Cleverboek. Het is gebouwd rond die samenwerking: de klant factureert en levert zelf aan in zijn eigen administratie, de boekhouder werkt in dezelfde actuele cijfers en doet de btw-aangifte.

Wat kost boekhoudsoftware voor een accountants- of administratiekantoor?

Dat verschilt per prijsmodel. Exact Online rekent per gebruiker en pakket, Twinfield per gebruiker en per administratie, Yuki en Minox per klantdossier, AFAS met een maatwerkofferte en e-Boekhouden.nl met staffelprijzen per module. Cleverboek kost €5 exclusief btw per klantadministratie per maand, met alle functies.

Kost een extra medewerker op mijn kantoor meer aan software?

Bij pakketten die per gebruiker rekenen wel. Bij Cleverboek niet: daar betaal je alleen per klantadministratie, dus een extra boekhouder, assistent of stagiair kost niets extra.

Waarom zou een kantoor meerdere pakketten naast elkaar gebruiken?

Omdat klanten verschillen. Veel kantoren houden complexe dossiers in Exact Online, Twinfield, Minox of Yuki, en zetten de zzp- en mkb-administraties in Cleverboek. Zo betaal je voor eenvoudige klanten niet mee aan functies die je niet gebruikt.